明朝末年，民不聊生，官逼民反，起义队伍纷纷打出少林旗帜锦衣卫总管王澄把少林寺视为眼中钉，蓄意控制少林，他指使爪牙祁天远削发为僧，法号了空，并假传圣旨，命祁为少林寺主持。少林寺罗汉堂弟子慧能得悉王澄阴谋，立即赶回寺院。途经荒原时，帮助马主林苍一家制服惊马。林苍大女儿林婴深为感激，与慧能互赠礼物留念。这时，王澄已带领锦衣卫包围了少林寺，逼迫主持圆慧让位于祁天远。众僧不服，祁天远在与圆慧比武时暗下毒手，幸亏慧能及时赶到，奋力迎战，将圆慧救藏经阁。圆慧伤势严重，取出少林之宝“木锦袈裟”，让慧能及罗汉堂众弟子将宝衣送法华寺交圆秀师叔收藏。只要“架裟”在，少林寺就有复兴之日。圆慧为营救少林众僧，自焚而死。慧能、慧慈带领小师弟突围而出。为掩护众师弟，躲避追捕，慧能独自先行。途中，遇到祁天远，双方交手拼杀，慧能受伤昏倒，被林苍一家所救。不久，祁天远带卫士追踪而来，林苍为救慧能而死，林家三姐妹也被打散。慧能与林缨流落武当山，被玄机真人收留。祁天远追踪慧能来到武当山。当玄机了解真情后，不顾门派之别，逐走祁天远。慧慈在护送“袈裟”。当悟清、悟心在武当山找到慧能时，他已从玄机真人处学得破祁天远之绝招。慧能告别玄机真人，返回少林。玄机派师弟清风随行相助。归途中，慧能又与林家姐妹会合。就在祁天远举行接任少林寺主持仪式时，慧能一行赶回少林寺，经过一场生死搏斗，慧能杀了祁天远，林家姐妹救出众僧人。慧能在众僧拥戴下，接任了少林寺第28代主持。